-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
GyrB.fa
180 lines (180 loc) · 8.77 KB
/
GyrB.fa
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
>GYRB_PSEPU/222-393
GLRAFVEYLNTNKTPVNSQVFHFSVQREDGVGVEVALQWNDSFNENLLCFTNNIPQRD
GGTHLVGFRSSLTRSLNSYIEQEGLAKKNKVATTGDDAREGLTAIISVKVPDPKFSSQTK
DKLVSSEVKTAVEQEMNKYFSDFLLENPNEAKAVVGKMIDAARAREAARKAREM
>GYRB_ECOLI/220-390
GIKAFVEYLNKNKTPIHPNIFYFSTEKDGIGVEVALQWNDGFQENIYCFTNNIPQRDGGT
HLAGFRAAMTRTLNAYMDKEGYSKKAKVSATGDDAREGLIAVVSVKVPDPKFSSQTK
DKLVSSEVKSAVEQQMNELLAEYLLENPTDAKIVVGKIIDAARAREAARRAREM
>GYRB_BUCAP/221-391
GIKAFIKFLNKNKFPINLNIFYFRCIKNQIELEIAIQWNNSHQENILCFTNNIPQKDGGTHLS
GFRAGITRTLNLHIEREGYNKKNKTIITGEDTREGLTAIISIKIPDPKFSSQTKDKLVSSEVK
SVIESLINENLIEYLLENPIDAKFIIQKIINSAKIREAARRAREI
>GYRB_NEIGO/224-394
GVAGFVQYMNRKKTPLHEKIFYAFGEKDGMSVECAMQWNDSYQESVQCFTNNIPQRD
GGTHLTALRQVMTRTINSYIEANEVAKKAKVETAGDDMREGLTCVLSVKLPDPKFSSQT
KDKLVSGEIGPVVNEVINQALTDFLEENPNEAKIITGKIVDAARARQAARKAREI
>O86093/223-393
GVRGFVEYMNRSKTVLHPKPFYAVGEKDGMTIEVSMQWNDSYAETVQCFTNNIPQRD
GGTHLTGLRTAMTRTLNNYIEQNELAKKAKIETTGDDMREGLTCVLSVKVPEPKFSSQT
KDKLVSSEVQPVVQEVVAAKLAEFLLENPVDAKVICNKIIDAARARDAARKAREM
>GYRB_CLOAB/222-393
GLKSFVSYLNRNKEVVFKEPIYVEGSIDSNYSVEIALQYNDGYNENIFSFANNIHTIEGGT
HLAGFKTALTRVINDYAKKFGYLKENDKNLSGEDIREGLTAVVSVKLTEPQFEGQTKTK
LGNTEVRGIVDSIISERVSTYLEENPQIGKLVIDKALVASRAREAAKKAREI
>Q59957/230-400
GIASYVEYINENKDVIFDTPIYTDGEMDDITVEVAMQYTTGYHENVMSFANNIHTHEGG
THEQGFRTALTRVINDYARKNKLLKDNEDNLTGEDVREGLTAVISVKHPNPQFEGQTKT
KLGNSEVVKITNRLFSEAFSDFLMENPQIAKRIVEKGILAAKARVAAKRAREV
>GYRB_BACHD/224-394
GIASFVEHLNRTRETLHETPIHIEGEKQGVYVEIAVQYNDGFTSNIYSFANNINTHEGGTH
ESGFKTGLTRVINDYARKHNLFKESDPNLTGEDVREGLTAIISVKIPDPQFEGQTKTKLG
NSEARTITDSLFTEHFSRFLIEHPQVARKLVDKGLMASRAREAAKKAREL
>GYRB_BACSU/225-395
GIKSYVEYLNRSKEVVHEEPIYIEGEKDGITVEVALQYNDSYTSNIYSFTNNINTYEGGTH
EAGFKTGLTRVINDYARKKGLIKENDPNLSGDDVREGLTAIISIKHPDPQFEGQTKTKLG
NSEARTITDTLFSTAMETFMLENPDAAKKIVDKGLMAARARMAAKKAREL
>GYRB_STAAW/231-401
GIKSYVELLNENKEPIHDEPIYIHQSKDDIEVEIAIQYNSGYATNLLTYANNIHTYEGGTH
EDGFKRALTRVLNSYGLSSKIMKEEKDRLSGEDTREGMTAIISIKHGDPQFEGQTKTKLG
NSEVRQVVDKLFSEHFERFLYENPQVARTVVEKGIMAARARVAAKKAREV
>GYRB_HALSQ/225-396
GIREFVEYLNETKTALHDDVIYYDDESEGIEVEIAMQATDELQGSIHAFANNINTREGGT
HLTGFKTALTRVVNDYANSHDMLDDLDGDNLRGEDVREGLTAVISVKHPDPQFEGQTK
TKLGNSEVRGIVESVTHQQLGTFFEENPDTATAIISKAVEAARARKAAKQAEEL
>O85119/222-396
GIQSFVSYLNQNKEILFPNPIYIQGSRPGDDGDIEFEAALQWNSGYSELIYSYANNIPTRQ
GGTHLTGFSTALTRAVNSYIKAHNLSKSDKLSLTGEDIKEGLVAIVSVKVPNPQFEGQTK
QKLGNSDVGSVSQQISGEVLTTFLEENPQIAKTIVDKVFVAAQAREAAKRAREL
>GYRB_MYXXA/233-403
GISSFVEYLNKSKQTLHDKPISFSTEREGVMLDIAMQWNDGYDERIYTFANNINTHEGGS
HLSGFKAALTRTLNSYAEKGSLWKDLKETPTGEDAREGLSAVISVKLTNPQFEGQTKTK
LGNSEVKGLVEQMVNDQLGSFLEETPMVAKKVVAKIGDACRARLAARKARET
>GYRB_TREPA/222-395
GIRHFVSYLNRGKSVVPERPLYIEGSKSDVLVEVALQYHDGYTENVQSFVNDINTREGG
THLEGFKSALTRVANDFLKKSPKLAKKIEREEKLVGEDVRAGLTVVLSVKIPEPQFEGQT
KTKLGNSEVRGIVDSLVGERLTLYFEQNPGVLTKILEKSIAEAQARLAARRAKEA
>GYRB_TREDE/223-396
GISQFVSYLNESKQVFPKSPVFIEGEKNDILCEVAIQYNDGYNENLLSFVNDINTREGGTH
LEGFKTALTRVMNDFLKKYPKLVKKMDKEEKLTGEDVRAGLTAIVSVKVPEPQFEGQT
KTKLGNSDVRGIVDSFVNEKLTLFFEQNPNEVEKVLEKCVAEAAARIAARRAKEA
>GYRB_SYNY3/226-397
GIREYVTYMTTDKTPLHEEIIYTSGEKNDVQVEVALQWCVDAYSDTLLGFANNIRTIDG
GTHLEGLKAVLTRTLNSVARKRNKLKDGDSNLGGENIREGLTGVISVKVPDPEFEGQTK
TKLGNTEVRGIVDTLVGEALTEFLEFNPGVADAIIEKAVQAFKAAEAARRAREL
>GYBR_STRSH/256-429
GITDFVVHLNARKGEPAHPSVITIAAEDTERLLSAEIALQWNGQYTDSVYSYANAIHTHE
GGTHEEGFRTALTTVVNRYAREKRLLRDKDANLSGEDIREGLTAIISVNVGEPQFEGQTK
TKLGNTEVRTLLQKIVHEHLADWFDRNPNEAVDIVRKAVQAATARVAARKARDL
>GYBS_STRSH/263-436
GIVDFVKYLNSRKGDLIHPTVIDIDAEDKERMLSVEIAMQWNSQYSEGVYSFANTIHTHE
GGTHEEGFRAAMTGLVNRYAREKKFLREKDDNLAGEDIREGLTAIISVKLGEPQFEGQT
KTKLGNTEAKTFVQKIVHEHLTDWFDRHPNEAADIIRKSIQAATARVAARKARDL
>GYRB_MYCLE/259-429
GLVDFVKHINRTKTPIQQSIIDFDGKGAGHEVEVAMQWNGGYSESVHTFANTINTHEGG
THEEGFRSALTSVVNKYAKDKKLLKDKDPNLTGDDIREGLAAVISVKVSEPQFEGQTKT
KLGNTEVKSFVQRVCNEQLIHWFEANPVDAKAVVNKAISSAQARIAARKAREL
>O52165/219-389
GIKEYINFVGEGKKFISEIFYASGMCNYGIEIDLALVYTDGYSESIYSFVNNVKTRDGGTH
ETALKTALTKTINDYASKNGLAKKITFEGSDVREGIIAVISLKVPEEILEFVGQTKDKLGT
PEAREVVEDFVSQKFYFFLNENKIEAEKIISKIKKAYEAKVAARNAKNE
>PARE_BACSU/223-394
GIEAFVAYLNEEKDVLSEVVSFEGEHHSIEVDFAFQFNDGYSENILSFVNNVRTKDGGTH
ESGAKTAMTRAFNEYARKVALLKEKDKNLEGTDIREGLSAIISVRIPEELLQFEGQTKGK
LGTSEARSAVDAIVSEQLAYFLEENRDTATLLVKKAIKASQAREAARKAREE
>P95681/224-395
GIKEFVSYVNEGKEVLHDVATFSGEANGIEVDVAFQYNDQYSESILSFVNNVRTKDGGT
HEVGFKTAMTRVFNDYARRINELKTKDKNLDGNDIREGLTAVVSVRIPEELLQFEGQTK
SKLGTSEARSAVDSVVADKLPFYLEEKGQLSKSLVKKAIKAQQAREAARKARED
>PARE_STRPN/227-398
GVQDFVSYLNEDKEILTPVLYFEGEDNGFQVEVALQYNDGFSDNILSFVNNVRTKDGGT
HETGLKSAITKVMNDYARKTGLLKEKDKNLEGSDYREGLAAVLSILVPEEHLQFEGQTK
DKLGSPLARPVVDGIVADKLTFFLMENGELASNLIRKAIKARDAREAARKARDE
>GYRB_AQUAE/226-396
GIEELVKYLNEGKEPLFKDIIRIQGEKEGVIVDIAFQYVKDYKERIESFVNNIKTVEGGTH
VTGFRSGLSKAVIRMAQGLKLAKELKKSFTGEDVREGLTAVVACKVPNPQFEGQTKTK
LGNQNVKQIVESITYDFLTSYFEKKRDVLKAIVEKAIEAALAREAAKKAKEL
>GYRB_THEMA/218-394
GIVEYVKYLNRGKKALHDVIHIKRTEKVKTKNGEDEVIVEIAFQYTDSYSEDIVSFANTI
KTVDGGTHVTAFKSTLTRLMNEYGKKHNFLKKDDSFQGEDVREGLTAVISVYVKNPEF
EGQTKSKLGNEEVKEAVTKAMREELKKIFDANPELVKTILSKIMSTKQAREAAKRAREM
>GYRB_BORHE/219-389
GIKAFVDYITNNSKNIQNEPYFIEGSCDDVIVSVGLKWTEGYSDHILSFVNNINTREGGTH
VAGFKSGFLKAMSEAFRDSKISKKDVPSLTLDDFKEGLTAVISIKIPEPQFEGQTKGKLGN
SYVKKIVETIVHDGLLKVIDDNLLEVDIILNKAIRAARAREAARKARES
>GYRB_BORBU/224-394
GIKSFVDYLTNDSKAFQSEPYYIDGFINDVIVNVGLKWTESYSDNILSFVNNINTREGGTH
VMGFRSGLTKAMNEAFKNSKISKKDIPNLTGDDFKEGLTAVISVKVPEPQFEGQTKSKL
GNSEIRKIVEVVVYEHLLEIINLNPLEIDTILGKAIKAARAREAARKARES
>GYRB_HELPJ/221-389
GLKQFVKDSAKKELLTPIIAFKSMDEETRTSIEVALAYADDYNENTLSFVNNIKTSEGGT
HEAGFKMGLSKAILQYIDNNIKTKESRPISEDIKEGLIAVVSLKMSEPLFEGQTKSKLGSS
YARALVSKLVYDKIHQFLEENPNEAKIIANKALLAAKAREASKKAREL
>GYRB_SPICI/224-396
GIKDYVLELNKTIGTPLNDVFYVEGIEDNIVVEFGLQYNDNYSENIFSFCNNINTHEGGTH
EEGARLAIVREINNYFKNQINKNNKGNEDKFTWDDIKEGMTIIISIRHPEPQYEGQTNQKL
LNSEVKKIVSNIVGKGLSSYLLENPEDAKKIIEKISLSLKATIVAQRAKEI
>GYRB_MYCAT/227-404
GIIDYVSELNRGKKVIIPDIIYAEGTFRDKTPNAQDVIVNVAIQYNETYTSNIVSYANNIQT
GEGGTHEQGFYDALTRIYNKYAEDNKLFKNNNEKISREDTKDGLVAIISIKHTDPIFEGQ
TKGKLENKDARIATNKIISEQLERYMAENPSHAKAIIEKCLLTQRSRLAANAAREA
>GYRB_MYCHO/227-405
GLIDYVKELNKGKKLIVPEVIYAEGVFNDKNFTNGQDVIVEVAMQYNEAYTNSIVSYAN
NIQTIDGGTHEQGFYDALVRIYNNYAETNKLFKTSSEKITREDVKEGLVAIISIKHTDPIFE
GQTKGKLENKDARIATNKILSDSLERYLNENPEIARAIIEKCLLSQHTRLLEIKAREA
>GYRB_MYCPN/228-408
GLVQYIHHLNNEKEPLFEDIIFGEKTDTVKSVSRDESYTIKVEVAFQYNKTYNQSIFSFCN
NINTTEGGTHVEGFRNALVKIINRFAVENKFLKETDEKITRDDICEGLTAIISIKHPNPQYE
GQTKKKLGNTEVRPLVNSIVSEIFERFMLENPQEANAIIRKTLLAQEARRRSQEAREL
>GYRB_MYCGA/227-407
GIKQYVENLNASKEPIIPQIIYGEKKTKVTLPKRNLEVTMLLEVAFQYTNGYYNSTYSFC
NNIHTNQGGTHEEGFKNALYKIINRYALEKKFIKETDGKISKEDLSEGLTAIISIKHSEPQY
QGQTKDRLGNTEVREFTNSVVSELLERFFLENPEEAAKITAKAVSAMFSRKRSEAALES
>GYRB_MYCCA/221-391
GLVEFVKELVDDKTPVTDIITINNESKNIIVEIALQYTEDDNEIILGFANNVKTIDGGTHLV
GFKSGLIRAINDYAKDQKILKDKTKLDSNDLREGLVAIVTVKIPENLIEYEGQTKSKLGTS
DAKTVVEQIVYEFMSYWLIENKVLANKVIENALNAQKARIAAKQARQA
>PARE_MYCGE/220-391
GLVQFLDEINNTVETLGQKTLIKGEKDGIEVEVVFQFNQSDQETILSFANSIKTFEGGSHE
NGFCLAISDVINSYCRKYNLLKEKDKNFQLSEIRQGLNAIIKVNLPEKNIAFEGQTKSKLF
SKEVKNVVYELVQQHYFQFLERNNNDAKLIIDKLLNARKIKEQIKQQREL
>PARE_MYCPN/223-394
GISQYLDELNADSKQIAQKIFVSGTEDDIELEAVFQFIDGEDEKLLSFANSIRTSEGGSHEA
SFRQSVGDVINNYCRKYNFLKERDKNFEASEIREGLNGIIKVNLPEKIIAFEGQTKSKLFS
KEVKAVVQKLTQKHFFQFLERNSVDAKLIVEKLFYNRKLRQELKQQRQI
>PARE_MYCGA/221-392
GILEYLKYVNENKKSISKIIPFKGDYEKIVVDGCFQYTDNESELIISFANSVKTSEGGSHEN
GFKQAMLETINDYSKKYKLINNKDKGFDWSDLKEGLSVVLSVQVPEKIIAYEGQTKNKL
FTQEVKVAVAKILTQQLFYFLEENQADAKQLIERFKLIKEAKEAAKKAKEN
>PARE_CAUCR/277-451
GLADFLAERTKGLTTITPESFAGRIERQGEAGAVEWAVTWTPQGFGEHDGFMQSYCNT
VPTPEGGTHESGFRAALTRGLKAYAELKGEKRGTIITADDVVAQAGALISVFIKNPEFQG
QTKEKLSTSEAQRFVEASLRDPFDLWLSSSPKNAQALLEFVIERAEERLKRRKDKEV
>GYRB_BARBA/278-447
GLKDYLSLSLKNKHLVTAEIFSGKTQQLSGHGSVEWAIAWHNGDAYIQSYCNTIPTEEG
GTHETGLRQTLLRGLKAYAELIGNKRASIITSDDVMASTVVMLSVFIKDPQFVGQTKDR
LATTEAQRIVENAIRDPFDHWLANSPHEATKLLNWVIERAEERLKRRQDREI
>O68071/234-407
GLADYLAEALTGASTYSDKPFAGRVSFEEKYNIPGSVEWAINWTPVRDGFIHSYCNTVP
TPEGGTHEAGFWAAILKGIRAYGERINNKKAAQITREDMLTGGCALISIFIREPSFVGQTK
DRLSTEEAARWVENAVRDYFDTWLTTDTKAAGAILDFLVLRAEERLRRKAEKET
>Q9ZDU7/242-413
GLKDYLSSKISLDNLVIPEIFSGNIESTVDDIKLEWAICWQNNDTSAFMQSYCNTVPTPQG
GTHEQGLKSAILRGLKAYSEMIGNKKAANLTIEDILETASIVLSIFIVEPSFQGQTKEKLVS
NGVSKLVENIIKDHFDHFLSSDKVLATHLLEHVIAIAEFRRNKKNERNI
>Q9ZNP9/217-385
GLRSYLTDAVAELPRLPDEPFCGNLEGSKEAVSWALLWLPEGGESVQESYVNLIPTAQG
GTHVNGLRQGLLDAMREFCEFRNLLPRGVKLAPEDVWERIAFVLSMKMQEPQFSGQTK
ERLSSREAAAFVSGVVKDAFSLWLNEHAEIGLQLAELAISNAGRRLKAGKKV
>PARE_HAEIN/218-386
GLSDYLIEAVNGFETLPKKPFVGEFKGANEAVSWALLWLPEGGELIGESYVNLIPTIQGG
THVNGLRQGLLDAIREFCEFRNLLPRGVKLTADDIWDRCSYILSLKMQDAQFAGQTKER
LSSRQSAVFVSGVLKDAFSLWLNQNVQDAEKLAEIAISSAQRRLRAAKKV
>PARE_SALTY/218-386
GLNDYLGEAVNGLPTLPEKPFIGNFNGETEAVDWALLWLPEGGELLTESYVNLIPTMQG
GTHVNGLRQGLLDAMREFCEYRNILPRGVKLSAEDIWDRCAYVLSVKMQDPQFAGQT
KERLSSRQCAAFVSGVVKDAFSLWLNQNVQAAEQLAEMAIASAQRRLRAAKKV
>TOP2_ASFB7/254-422
LAKMYTLLSAPNSTIHTATIKADAKPYSLHPLQVAAVVSPKFKKFEHVSIINGVNCVKGE
HVTFLKKTINEMVIKKFQQTIKDKNRKTTLRDSCSNIFVVIVGSIPGIEWTGQRKDELSIA
ENVFKTHYSIPSSFLTSMTRSIVDILLQSISKKDNHKQVDVDKYTRAR