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File metadata and controls

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Ces scripts servent à lancer les programmes de MIDAS et à manipuler les fichiers d'input ou bien d'output.

Variables d'environnement

Les variables d'environnement suivantes sont possibles:

  • MIDAS_RAMDISKPATH: Cette variable définit le path vers le RAMDisk Par defaut, elle est égale à ${TMPDIR}.

  • MIDAS_SAVE_SPLITOBS: Si cette variable est égale à yes, on copie les observations qui ont été splittés mais conservés en RAMDisk dans le répertoire de travail de midas.Abs. Par défaut, cette variable est vide. Cela est utile pour débogguer le splitting des observations et pour examiner ce que les programmes MIDAS lisent comme fichier d'observations.

  • MIDAS_CONCURRENT_SPLITOBS: Cette variable controle le nombre de processus de splitting lancés en parallèle dans le script midas.mpi. Par défaut, elle n'est pas définie et ainsi aucune limite n'est imposée.

  • MIDAS_OBS_MPI_ORDERING: Si cette variable est égale à inverse, alors on utilisera la répartition MPI des observations telle que cela était utilisée dans les versions v_3.3.* et antérieures de MIDAS. Si elle est égale à regular, alors on utilisera la répartition définie dans les versions de MIDAS postérieures à v_3.3.

  • MIDAS_MPI_BARRIER_VERBOSE: Si cette variable est égale à yes, alors un set -x sera effectué dans le script midas.mpi_barrier.

midas.launch

Le script midas.launch est le script principal qui lance les programmes MIDAS qui servent dans l'assimilation et le contrôle de qualité. Ce script appelle les scripts suivants:

  • midas.check_ensemble
  • midas.tripotenml
  • midas.mpirun
  • midas.mpi
    • midas.splitobs
    • midas.mpi_barrier
  • midas.reunir_obs
    • midas.reunir_obs_mpi

midas.check_ensemble

Ce script verifie si tous les trials d'ensemble sont présents. Dans le cas où on appelle le script avec -fallback_mode égal à continue et qu'il manque des membres d'ensemble, on applique l'algorithme de contigence.

midas.tripotenml

Ce script sert à modifier des entrées dans un namelist fortran. On l'utilise pour changer la valeur de l'étiquette.

midas.mpirun

Ce script est un wrapper autour de r.run_in_parallel pour rassembler le code qui doit être exécuté avant de lancer le MPI.

midas.mpi

Ce script est lancé en MPI et est celui qui appelle vraiment les programmes de MIDAS. C'est ce script qui appelle midas.splitobs qui fait le splitting en parallèle des observations avant d'appeler les véritables programmes MPI. On peut limiter le nombre de processus en parallèle envoyés avec la variable MIDAS_CONCURRENT_SPLITOBS.

midas.splitobs

Ce script fait le splitting des observations avant de lancer le programme MIDAS qui a besoin des observations déjà splittées. On supporte les fichiers BURP et SQLite.

midas.mpi_barrier

Ce script permet de resynchronier toutes les tuiles MPI après le splitting des observations et avant de lancer le programme MPI. Sinon, on obtient des timeout avec des erreurs Alarm call sur les PPP.

midas.reunir_obs

Ce script est le driver principal pour rassembler les observations qui ont ete splittées par midas.splitobs et modifiées par le programme MIDAS. On appelle midas.reunir_obs_mpi pour chaque famille.

midas.reunir_obs_mpi

Ce script est lancé par midas.reunir_obs et fait le rassemblage des observations pour une seule famille. On peut l'appeler interactivement avec:

fam=al
rm -f obsfiles_${fam}.updated/{obs${fam},TABLES_REUNIR} obs${fam}
midas.reunir_obs_mpi -obsin $PWD -obsout $PWD -families2process ${fam}