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p values should be at range of (0, 1). #118

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wangfei20201127 opened this issue Mar 13, 2024 · 6 comments
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p values should be at range of (0, 1). #118

wangfei20201127 opened this issue Mar 13, 2024 · 6 comments

Comments

@wangfei20201127
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您好,我是中国农业科学院的博士生王斐,我是在解决不了这个问题,一直说我的P值有问题,我们付费请您远程帮我看一下,您看是否可以,您可以直接通过手机微信联系我,18515952091,谢谢您

@Liny2333
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Liny2333 commented May 8, 2024

你好请问你找到解决方法了吗?我也遇到了一样的问题,我的目的是画环形曼哈顿图,我发现是因为我的p值存在0的值就会报错,但是我的数据不能删除那些0值。

@wangfei20201127
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Author

wangfei20201127 commented May 8, 2024 via email

@YinLiLin
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YinLiLin commented May 8, 2024

你好,统计检验的P值理论上不可等于0,如果不是P值,存在0的情况,可以添加参数LOG10=FALSE;如果是P值,需要弄清楚出现0的原因,针对具体情况调整数据

@Liny2333
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你好,统计检验的P值理论上不可等于0,如果不是P值,存在0的情况,可以添加参数LOG10=FALSE;如果是P值,需要弄清楚出现0的原因,针对具体情况调整数据
你好,感谢你的回复,我也意识到了这一点,但是我的数据是p值和fst值,这两个轨道的其中一个需要添加参数LOG10=FALSE,而另一个不需要,我就不知道怎么设置了。

@YinLiLin
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Owner

@Liny2333 可以先把数据进行转换,比如把p值提前用-log10转换好,然后再把替换好的数据赋值给CMplot,并设置参数LOG10=FALSE即可实现。

@Liny2333
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@Liny2333 可以先把数据进行转换,比如把p值提前用-log10转换好,然后再把替换好的数据赋值给CMplot,并设置参数LOG10=FALSE即可实现。

谢谢,太有帮助了!!

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