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Summary

• Introduction
• Documentation
  • Setup
  • References
  • Analysis
  • Parameters
  • Recipes
  • Code
    • Best Practise
    • Adding an env
  • API
    • Define Parameters
    • Download References
    • Identifiers
    • Initiation File
    • IO
    • Modules
    • Path
    • Pedigree
    • QC metrics
    • Sample info
    • Tests
      • Log
      • Data
    • Subroutines
  • Cli