-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 2
/
Makefile_HPC_cray
225 lines (191 loc) · 8.42 KB
/
Makefile_HPC_cray
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
FC = ftn
CC = cc
MODCMD = -J
OBJDIR = obj
SRCDIR = src
MODDIR = mod
MAINDIR=main
SAODIR=system_and_options
TYPDIR=types
INTDIR=interfaces
TASKDIR=tasks
PHYSDIR=physics
CALCDIR=calculations
PAWDIR=libpaw
#Set MKLROOT environment variable
LINALG = -Wl,--start-group ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_cdft_core.a ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_sequential.a ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_core.a ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a -Wl,--end-group -lpthread -lm -ldl
#Set MPICH_DIR environment variable
MPI_COMPILE_FLAGS = -I${MPICH_DIR}/include -I${MPICH_DIR}/lib
MPI_LINK_FLAGS = -Wl,-rpath,${MPICH_DIR}/lib -L${MPICH_DIR}/lib -lmpi -lmpichf90
MPI_INC_DIR= -I${MPICH_DIR}/include
#Set FFTW_DIR environment variable
FFTW_COMPILE_FLAGS =-I$(FFTW_DIR)/../include -I$(FFTW_DIR)
FFTW_LINK_FLAGS =-Wl,-rpath,$(FFTW_DIR) -L$(FFTW_DIR) -lfftw3_mpi -lfftw3 -lm -lfftw3_threads
#Set XC_DIR environment variable
XC_COMPILE_FLAGS =-I$(XC_DIR)include -I$(XC_DIR)lib
XC_LINK_FLAGS = -Wl,-rpath,$(XC_DIR)lib -L$(XC_DIR)lib -lxcf03 -lxc
FFT=fftw
parallel=mpi
xc=libxc
INC= -I$(MODDIR)/$(PAWDIR) -I$(MODDIR)/$(TYPDIR) -I$(MODDIR)/$(INTDIR) -I$(MODDIR)/$(SAODIR) -I$(MODDIR)/$(TASKDIR) -I$(MODDIR)/$(PHYSDIR) -I$(MODDIR)/$(CALCDIR) -I$(MODDIR)/$(MAINDIR) $(MPI_COMPILE_FLAGS) $(FFTW_COMPILE_FLAGS) $(XC_COMPILE_FLAGS) $(AOCL_COMPILE_FLAGS)
MOD_DIRECTORIES= $(MODDIR)/$(MAINDIR) $(MODDIR)/$(CALCDIR) $(MODDIR)/$(PHYSDIR) $(MODDIR)/$(TASKDIR) $(MODDIR)/$(SAODIR) $(MODDIR)/$(INTDIR) $(MODDIR)/$(TYPDIR) $(MODDIR)/$(PAWDIR)
OBJ_DIRECTORIES= $(OBJDIR)/$(MAINDIR) $(OBJDIR)/$(CALCDIR) $(OBJDIR)/$(PHYSDIR) $(OBJDIR)/$(TASKDIR) $(OBJDIR)/$(SAODIR) $(OBJDIR)/$(INTDIR) $(OBJDIR)/$(TYPDIR) $(OBJDIR)/$(PAWDIR)
LINK = $(AOCL_LINK_FLAGS) $(LINALG) $(MPI_LINK_FLAGS) $(XC_LINK_FLAGS) $(FFTW_LINK_FLAGS)
$(shell mkdir -p $(MOD_DIRECTORIES))
$(shell mkdir -p $(OBJ_DIRECTORIES))
OBJPAW= \
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/libpaw_libxc.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_libpaw_defs.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_libpaw_mpi.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_libpaw_tools.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_libpaw_libxc.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paral_atom.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_numeric.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_sphharm.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_io.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawang.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawrad.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawtab.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_an.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_ij.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawfgrtab.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_finegrid.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawcprj.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawrhoij.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawdij.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawxc.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_atom.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_gaussfit.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawxmlps.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_pawpsp.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_init.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_occupancies.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_correlations.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_denpot.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_nhat.o\
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/m_paw_onsite.o
OBJTYPE= \
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/types.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/parallel_type_$(parallel).o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/shared_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/constants.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/numerics.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/odp_type_$(FFT).o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/element_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/atom_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/grids_type_$(FFT).o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/system_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/xc_type_$(xc).o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/tf_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/td_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/ewald_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/KG_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/DOS_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/tasks_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/stochastic_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/stopping_type.o\
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/simulation_type.o
OBJINT = \
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/utils.o\
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/$(FFT).o\
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/xc_interface_$(xc).o\
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/parallel_$(parallel).o\
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/lapack.o\
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/linalg.o\
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/splines.o
OBJSAO = \
$(OBJDIR)/$(SAODIR)/inputs.o\
$(OBJDIR)/$(SAODIR)/grids_$(FFT).o\
$(OBJDIR)/$(SAODIR)/odp_$(FFT).o
OBJTASK = \
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/operations_3D.o\
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/Spherical_Harmonics.o\
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/field_gradient.o\
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/distribute_field.o\
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/FFT2Matrix.o\
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/Fourier.o\
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/read_in.o
OBJPHYS = \
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Ewald.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Hartree.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Kinetic.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/External_Field.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/XC.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Density.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/HGH_Pseudopotentials.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/PAW_Pseudopotentials.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Local_Ion.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Non_Local_Ion.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Apply_Hamiltonian.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Non_Local_Ion_EnFoSt.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Chebychev.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Stochastic.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Thermostat.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Thomas_Fermi.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Entropy.o\
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/Chemical_Potential.o
OBJCALC = \
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/allocate_memory.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Orbital_Free_Min.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Update_Potentials_Energies.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/initialization_finalization.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Eigen_LOBPCG.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Eigen_ChebFilter.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Eigen_RMM_DIIS.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Stress_Pressure.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/SCF.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Stopping_Power.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Current.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Time_Dependent.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Kubo_Greenwood.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/DensityofStates.o\
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/Simple_Tests.o
OBJMAIN = \
$(OBJDIR)/$(MAINDIR)/main.o
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(PAWDIR)/%.c
$(CC) $(INC) $(CFLAG) -o $@ -c $<
$(OBJDIR)/$(PAWDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(PAWDIR)/%.F90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(PAWDIR)/
##Compilation order types > interfaces(libraries) > systems & option > tasks > physics > main
$(OBJDIR)/$(TYPDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(TYPDIR)/%.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(TYPDIR)/
$(OBJDIR)/$(INTDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(INTDIR)/%.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(INTDIR)/
$(OBJDIR)/$(SAODIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(SAODIR)/%.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(SAODIR)/
$(OBJDIR)/$(TASKDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(TASKDIR)/%.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(TASKDIR)/
$(OBJDIR)/$(PHYSDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(PHYSDIR)/%.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(PHYSDIR)/
$(OBJDIR)/$(CALCDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(CALCDIR)/%.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $< $(MODCMD)$(MODDIR)/$(CALCDIR)/
$(OBJDIR)/$(MAINDIR)/%.o: $(SRCDIR)/$(MAINDIR)/main.f90
$(FC) $(INC) $(FFLAG) -o $@ -c $<
cray: FC = ftn
cray: CC = cc
cray: FFLAG = -Ofast -I${MKLROOT}/include
cray: CFLAG = -Ofast -I${MKLROOT}/include
cray: LDFLAGS = $(FFLAG)
cray: LINALG = -Wl,--start-group ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_gf_lp64.a ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_sequential.a ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_core.a -Wl,--end-group -lpthread -lm -ldl
cray: MODCMD = -J
cray: main.exe
debug: FC=ftn
debug: CC= cc
debug: FFLAG = -g
debug: LDFLAGS = $(FFLAG)
debug: LINALG = -llapack -lblas
debug: main.exe
main.exe: $(OBJPAW) $(OBJTYPE) $(OBJINT) $(OBJSAO) $(OBJTASK) $(OBJPHYS) $(OBJCALC) $(OBJMAIN)
$(FC) $(LDFLAGS) $(INC) -o main.exe $(OBJPAW) $(OBJTYPE) $(OBJINT) $(OBJSAO) $(OBJTASK) $(OBJPHYS) $(OBJCALC) $(OBJMAIN) $(LINK)
#Copy module files into src directories for visual studios autodebugging
$(shell cp $(MODDIR)/$(PAWDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(PAWDIR)/ )
$(shell cp $(MODDIR)/$(TYPDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(TYPDIR)/ )
$(shell cp $(MODDIR)/$(INTDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(INTDIR)/ )
$(shell cp $(MODDIR)/$(SAODIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(SAODIR)/ )
$(shell cp $(MODDIR)/$(TASKDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(TASKDIR)/ )
$(shell cp $(MODDIR)/$(PHYSDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(PHYSDIR)/ )
$(shell cp $(MODDIR)/$(CALCDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(CALCDIR)/ )
$(shell cp $(MPI_INC_DIR)/mpi.mod $(SRCDIR)/$(INTDIR)/ )
clean :
rm -rf $(OBJDIR) $(MODDIR) $(LIBDIR) $(SRCDIR)/$(PAWDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(TYPDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(INTDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(SAODIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(TASKDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(PHYSDIR)/*.mod $(SRCDIR)/$(CALCDIR)/*.mod
rm main.exe