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Edición 2024 💜 parte 2
⭐ Objetivo
Fomentar la formación y crecimiento en bioinformática a través de cursos gratuitos para toda la comunidad interesada.
Viernes de 11:30 am a 1:30 pm CDMX (GMT-6).
NOTA: El horario puede variar unos días dependiendo del instructor.
- Inicio: 6 de septiembre de 11:30 am a 1:30 pm.
- Termino: 6 de diciembre.
- Clases híbridas en:
- Aula de Bioinformatica de LIIGH
- Google meet
- Grabación de las sesiones 📹.
- Este curso se contempla finalizar hasta el 6 de diciembre.
- Los cambios en horarios se anunciarán por correo y Discord.
Los cursos se imparten cada viernes, se les pide que se inscriban máximo el JUEVES A LAS 6 PM. Solicitudes recibidas posterior a este día y hora, no podrán asistir el viernes de esa semana.
Completa el siguiente Google form. Inscripciones abiertas del 8 de Agosto al 3 de septiembre, cierre 6 pm.
Para cualquier duda o problema mandar un correo con copia a los coordinadores del curso, la Dra. Evelia Coss ([email protected]) y el Dr. Israel Aguilar ([email protected]).
Gracias por hacer de nuestro grupo un lugar especial. ¡Espero que sigamos logrando grandes cosas junt@s!
Queremos recordarles que el acceso a la misma es exclusivo para quienes se registraron previamente a través del formulario, utilizando el correo de Gmail con el que se inscribieron. Por favor, no compartan el enlace de la clase libremente, ya que Google meet cuenta con un acceso limitado a 100 personas, y deseamos asegurarnos de que todos aquellos que se tomaron el tiempo de registrarse puedan participar. Es un curso gratuito y quedará grabado.
Se otorgará un diploma a los participantes que cuenten con el 80 % de las asistencias emitido por el LIIGH-UNAM, teniendo como representante a la Dra. Maria Avila.
ASISTENCIAS: Utilizaremos una extensión de Google Meet para registrar la asistencia. Esta herramienta registrará automáticamente el nombre de usuario de Gmail, la hora de entrada y el tiempo que permanezcan en la llamada. Les pedimos que, antes de la clase, se aseguren de que su nombre de usuario esté actualizado.
Además, les pedimos que, si no tienen la posibilidad de asistir a la clase completa (2 horas), consideren NO ingresar, de manera que puedan ceder su lugar a otra persona que pueda aprovechar la clase en su totalidad (solo hay 100 lugares en la llamada de Google meet). Queremos asegurarnos de que todos los participantes puedan disfrutar de una experiencia completa y enriquecedora de la mano de los instructores. Respeten el espacio y el tiempo que ellos también les proporcionen, por favor.
DIPLOMA: Es importante recordar que si la clase tiene una duración de 2 horas y permanecen menos tiempo (por ejemplo, 1h 30 min), esto se considerará una falta. Al inscribirse en el curso, se comprometieron a asistir y participar en las clases completas para poder recibir un diploma, para lo cual se requiere al menos un 80% de asistencia.
- Dr. Israel Aguilar - Posdoc y Coordinador del curso
- Dra. Evelia Lorena Coss Navarrete - Posdoc y Coordinadora del curso
- Dra. Joselyn Chávez - Rladies Cuernavaca, Posdoctoral Icahn School of Medicine en Mount Sinai
- Dra. Haydeé Peruyero - Rladies Morelia, Posdoctoral Centro de Ciencias Matematicas (CCM)
- Sofia Zorrilla - Rladies Morelia, estudiante de maestria PCBIOL en ENES Morelia
- Maria Jose Palma Martinez - Rladies Morelia, estudiante de doctorado
- Dra. Aline Pingarroni - Rladies Morelia, PI
Coordinadores: Dra. Evelia Coss y Dr. Israel Aguilar
Curso: Bases para la inferencia filogenética, construcción, lectura e interpretación de árboles filogenéticos, 27 agosto-26 septiembre 2024
- Fechas: Martes y jueves, del 27 agosto al 26 septiembre 2024 de 6 a 8 pm
- Clases Online
- Se grabaran las clases.
- Github: https://github.com/EveliaCoss/Filogenetic_Workshop2024
- Instructora: Dra. María Guadalupe Segovia Ramírez
- Formulario de inscripcion: aqui - Registro CERRADO (limitado a 100 personas en Google meet)
- Viernes 1. Creación de paquetes en R (6/sep/2024) - Joselyn Chávez
- Viernes 2. Introducción al paquete data.table en R, parte 1 (13/sep/2024) - Sofia Zorrilla
- Viernes 3. Introducción al paquete data.table en R, parte 2 (20/sep/2024) - Sofia Zorrilla
- Viernes 4. Analisis de variantes genetica con data.table en R, parte 1 (27/sep/2024) - Maria Jose Palma Martinez (9- 11 am)
- Viernes 5. Analisis de variantes genetica con data.table en R, parte 2 (4/oct/2024) - Maria Jose Palma Martinez (9- 11 am)
- Viernes 6. Git + Github (11/oct/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 7. Git + Github (18/oct/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 8. Circus plot en R (25/oct/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 9. Programacion defensiva con ggplot2, parte 1 (1/nov/2024) - Evelia Coss
- Viernes. (8/nov/2024) - NO HAY CLASES
- Viernes 10. Programar en R con chatGPT (15/nov/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 11. Creación de paginas web en R, parte 1 (22/nov/2024) - Haydeé Peruyero
- Viernes 12. Creación de paginas web en R, parte 2 (29/nov/2024) - Haydeé Peruyero
- Clase extra: jueves 5 dic - Crea tu CV - Aline (11:30-1:30) - Github
- Viernes 13. Programacion defensiva con ggplot2, parte 2 (6/dic/2024) - Evelia Coss
Este calendario se base en el Calendario de la UNAM.
- Fecha: Viernes 6 de septiembre 2024
- Instructora: Dra. Joselyn Chávez
- Presentación: Creación de paquetes en R
- Grabación: Clase1
- Fechas: Viernes 13 y 20 de septiembre 2024
- Instructora: Sofia Zorrilla
- Página del tutorial
- Repositorio Github: data.table_long
- Grabación: Clase2
- Grabación: Clase3
- Fechas: Viernes 27 de septiembre Y 4 de octubre 2024
- Instructora: Maria Jose Palma Martinez
- Horario: 9 a 11 am
- Descargar el siguiente archivo previo a la clase 4. Da click aqui
- Material Clase 4 y 5: Libro en Quarto - GWAS
- Github: Genetic_variants_datatable
- Reproduccion de la Figura 4 de Mexican Biobank advances population and medical genomics of diverse ancestries
- Grabación: Clase4
- Descargar el siguiente archivo previo a la clase 5. Da click Genotypes.vcf
- Grabación: Clase5
- Material extra:
- Visualizacion de variantes geneticas en mapa mundial
- 1000genomes
- Fechas: Viernes 11 y 18 de octubre 2024
- Instructor: Dr. Israel Aguilar
- Horario: 11:30-13:30 pm
- Manual: Mini guia uso de Git y Github
- Grabación: Clase6
- Grabación: Clase7
- Fechas: Viernes 25 octubre 2024
- Instructor: Dr. Israel Aguilar
- Horario: 11:30-13:30 pm
- Manual: Circular Visualization in R
- Script: peak-circos.R
- Grabación: Clase8
- Fechas: Viernes 1 noviembre 2024
- Instructora: Dr. Evelia Coss
- Horario: 11:30-13:30 pm
- Manual: Defensiva_ggplot2024
- Grabación: Clase9
- Proyecto final: Instrucciones, Entrega de reporte 5 de diciembre y presentacion de 15 min por equipo el 6 de diciembre.
- Fechas: Viernes 15 noviembre 2024
- Instructor: Dr. Israel Aguilar
- Horario: 11:30-13:30 pm
- Fechas: Viernes 22 y 29 noviembre 2024
- Instructora: Dra. Haydeé Peruyero
- Horario: 11:30-13:30 pm (22 noviembre 2024) y 10:30 a 12:30 (29 noviembre 2024)
- Manual: Creacion pagina web
- Grabación: Clase11
- Material: Pagina1 y Pagina2
- Grabación: Clase 12
- Fecha: Jueves 5 diciembre (11:30-1:30)
- Instructora: Aline Pingarroni
- Material: Github
- Grabación: Crea tu CV
- Fechas: Viernes 6 diciembre 2024 (final)
- Instructora: Dra. Evelia Coss
- Presentacion de exposiciones de proyectos: Instrucciones
- Proyectos finales:
- Julieth Lopez - Proyecto en Quarto, datos Grandes ligas de Beisbol.
- Erick Arroyo y Adriana Chacon - Proyecto, datos de starwars
- Erika Cruz y Amairani Cancino - Proyecto, datos de ardillas
El material de los VieRnes de Bioinformatica se distribuye públicamente a través de este repositorio GitHub bajo la Licencia No Comercial Creative Commons 4.0.
Creative Commons Licence This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0.
Los participantes han leído y comprendido el código de conducta de los VieRnes de Bioinformática, aceptando cumplir con las normas y directrices establecidas en el código de conducta.
Debido a que las clases son grabadas los participantes han autorizado de su aceptación en el registro el uso de su imagen en las mismas, tanto en las las grabaciones y toma de fotografías en las sesiones. De acuerdo al Aviso de Privacidad vigente del Laboratorio Internacional de Investigación sobre el Genoma Humano declarado en el sitio web: https://liigh.unam.mx/avisodeprivacidad/
Queremos agradecer al LIIGH - UNAM por el apoyo y facilidades prestadas para poder impartir estos cursos. Queremos explícitamente agradecer, de manera muy especial, a la Dra. Maria Avila, la Dra. Alejandra Medina-Rivera, Licenciada Eglee Lomelin, Jair Santiago y Luis Aguilar por su extraordinaria labor y por impulsar estos cursos para el crecimiento de todos.
Queridas compañeras de R-Ladies Morelia, quiero agradecerles sinceramente por todo su apoyo y entusiasmo. Trabajar juntas ha sido una experiencia increíble y valoro mucho cada momento compartido.
Cursos hechos con amor 💜