1.8.1

🐛 Corrections

• Correction de la migration Taxref v11 vers v13 pour les versions de PostgreSQL < 12

⚠️ Notes de version

• Vous pouvez passer directement à cette version, mais en suivant les notes des versions intermédiaires

1.8.0

🚀 Nouveautés

• Passage à la version 14 de Taxref, utilisée par défaut pour les nouvelles installations
• Intégration du référentiel BDC statuts (https://inpn.mnhn.fr/telechargement/referentielEspece/bdc-statuts-especes), peuplé lors du passage à Taxref v14. Pour des raisons de compatibilité avec GeoNature les anciens statuts de protection et les listes rouges sont toujours présents (#157)
• Support du stockage des medias sur les services de stockages S3 (#248 par @jbdesbas)
• Ajout d'un champs code_liste dans la table taxonomie.bib_listes pour utiliser des codes plutôt que des identifiants et faciliter l'interopérabilité des données entre outils
• Ajout d'un paramètre fields à la route /taxref/search/ afin de pouvoir récupérer dans la réponse des champs supplémentaires selon les besoins (#243)
• Recherche non sensible aux accents pour la route allnamebylist
• Mise à jour de AngularJS en version 1.8.0
• Mise à jour de différentes dépendances Python

🐛 Corrections

• Correction de la génération des vignettes des images

⚠️ Notes de version

• Exécuter la commande suivante pour ajouter l'extension PostgreSQL unaccent, en remplaçant la variable $db_name par le nom de votre BDD : sudo -n -u postgres -s psql -d $db_name -c 'CREATE EXTENSION IF NOT EXISTS "unaccent";'
• Exécutez le script SQL de mise à jour de la BDD (https://github.com/PnX-SI/TaxHub/blob/master/data/update1.7.3to1.8.0.sql)
• Suivez la procédure standard de mise à jour de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html#mise-a-jour-de-l-application
• Vous pouvez exécuter la mise à jour vers Taxref v14, en suivant la procédure et les scripts dédiés (https://github.com/PnX-SI/TaxHub/tree/master/data/scripts/update_taxref). Cela peuplera aussi la BDC statuts.
• Pour des raisons de compatibilité avec GeoNature, laissez les code_liste au format numérique pour le moment

1.7.3

🚀 Nouveautés

• Ajout de tests unitaires
• Mise à jour des dépendances (psycopg2 et SQLAlchemy)

🐛 Corrections

• Correction d'un bug sur la récupération des attributs des taxons (#235 par @jbdesbas)
• Script de récupération des médias sur INPN. Le script continue lorsqu'un appel à l'API renvoie un autre code que 200

1.7.2

🚀 Nouveautés

• Ajout du nom vernaculaire (nom_vern) dans la vue matérialisée taxonomie.vm_taxref_list_forautocomplete et dans la route associée (api/taxref/allnamebylist/)

🐛 Corrections

• Correction de la pagination des routes quand le paramètre offset est égal à zéro (nécessaire pour Sync-mobile)

⚠️ Notes de version

• Exécutez le script SQL de mise à jour de la BDD (https://github.com/PnX-SI/TaxHub/blob/master/data/update1.7.1to1.7.2.sql)
• Suivez la procédure standard de mise à jour de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html#mise-a-jour-de-l-application

1.7.1

🐛 Corrections

• Correction et homogénéisation des paramètres offset et page sur toutes les routes (#229)
• Correction de la route de récupération de la configuration sans le "/" (#228)
• Suppression des doublons de la route allnamebylist, entrainant un nombre de résultats différent du paramètre limit fourni

1.7.0

🚀 Nouveautés

• Mise à jour de Taxref en version 13
• Intégration brute de la Base de connaissance des statuts des espèces correspondant à la version 13 de Taxref, en vue de la révision des statuts de protection (#157)
• Migration de la librairie OpenCV vers PIL (plus légère) pour le redimensionnement des images et suppression de la librairie dépendante NumPy (#209)
• Mise à jour des librairies Python (Flask 1.1.1, Jinja 2.11.1, Werkzeug 1.0.0, gunicorn20.0.4) et Javascript (AngularJS 1.7.9, Bootstrap 3.4.1)
• Suppression du paramètre id_application du fichier static/app/constants.js de façon à ce qu'il soit récupéré de façon dynamique
• Ajout de fonctions génériques de détection, suppression et création des vues dépendantes dans le schéma public (data/generic_drop_and_restore_deps_views.sql)
• Route allnamebylist enrichie avec un paramètre offset pour que l'application Occtax-mobile puisse récupérer les taxons par lots (#208)
• Utilisation du cd_sup au lieu du cd_taxsup dans la fonction taxonomie.find_all_taxons_children() pour prendre en compte les rangs intermediaires
• Ajout de la colonne famille au modèle VMTaxrefHierarchie (#211)
• Ajout d'un manuel administrateur listant les fonctions SQL de la BDD (par @jbdesbas)
• Révision et compléments de la documentation (par @ksamuel)
• Ajout d'un lien vers le manuel utilisateur depuis la barre de navigation de l'application
• Changement de modélisation de la table vm_taxref_list_forautocomplete qui redevient une vue matérialisée (#219). A rafraichir quand on met à jour Taxref

🐛 Corrections

• Correction d'un bug de suppression des attributs suite à une erreur d'enregistrement (#80)
• Correction d'un bug lors de la modification d'un média
• Correction des doublons (#216) et des noms manquants (#194) dans la vue matérialisée vm_taxref_list_forautocomplete (#219)
• Impossibilité d'associer une valeur nulle à un attribut
• Nettoyage et suppression des scripts SQL et de leurs mentions à GeoNature v1 et UsersHub v1

⚠️ Notes de version

• Vous pouvez supprimer le paramètre id_application du fichier static/app/constants.js car il n'est plus utilisé
• Vous pouvez supprimer les anciennes listes de taxons qui correspondaient à des groupes utilisés par GeoNature v1 (Flore, Fonge, Vertébrés, Invertébrés, Amphibiens, Oiseaux, Poissons...)
• Exécutez le script SQL de mise à jour de la BDD (https://github.com/PnX-SI/TaxHub/blob/master/data/update1.6.5to1.7.0.sql)
• Suivez la procédure standard de mise à jour de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html#mise-a-jour-de-l-application
• Vous pouvez mettre à jour Taxref en version 13 avec la documentation et les scripts du dossier data/scripts/update_taxref/ (https://github.com/PnX-SI/TaxHub/tree/master/data/scripts/update_taxref)

1.6.5

Corrections

• Compatibilité Python > 3.5 : utilisation de <ImmutableDict>.to_dict() pour convertir le résultat d'un formulaire en dictionnaire (Corrige le bug d'ajout de média)

1.6.4

Corrections

• Logging des erreurs lorsque des exceptions sont attrapées (évite les erreurs silencieuses)
• Gestion des taxons synonymes dans la vue gérant la recherche des taxons (vm_taxref_list_forautocomplete)
• Modification de la méthode d'installation du virtualenv
• Utilisation de nvm pour installer node et npm (uniformisation avec GeoNature)

Notes de version

• Exécuter le script de migration SQL https://github.com/PnX-SI/TaxHub/blob/master/data/update1.6.3to1.6.4.sql
• Suivez la procédure standard de mise à jour de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html#mise-a-jour-de-l-application

1.6.3

Nouveautés

• Intégration du trigramme dans le champs de recherche de taxon de TaxHub
• Route de recherche de taxon : Possibilité de limiter à un rang
• Ajout de la fonction taxonomie.find_all_taxons_children qui renvoie tous les taxons enfants d'un taxon à partir d'un cd_nom
• Mise à jour de OpenCV en 3.4.2

Corrections

• Suppression de l'index taxref.i_taxref_cd_nom inutile (#192)

Notes de version

• Exécuter le script de migration SQL : https://github.com/PnX-SI/TaxHub/blob/master/data/update1.6.2to1.6.3.sql
• Suivez la procédure standard de mise à jour de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html#mise-a-jour-de-l-application

1.6.2

Nouveautés

• Ajout du rang de l'espèce et du cd_nom sur l'API de recherche des taxons (autocomplete dans la table vm_taxref_list_forautocomplete), utilisée par GeoNature

Corrections

• Ajout d'index uniques pour le rafraichissement des vues matérialisées
• Correction de l'index sur la table taxonomie.vm_taxref_list_forautocomplete pour le trigramme
• Centralisation des logs supervisor et gunicorn dans un seul fichier (taxhub_path/var/log/)

Note de version

• Afin que les logs de l'application (supervisor et gunicorn) soient tous écrits au même endroit, modifier le fichier taxhub-service.conf (sudo nano /etc/supervisor/conf.d/taxhub-service.conf). A la ligne stdout_logfile, remplacer la ligne existante par : stdout_logfile = /home/<MON_USER>/taxhub/var/log/taxhub-errors.log (en remplaçant <MON_USER> par votre utilisateur linux)
• Pour ne pas avoir de conflits de sessions d'authentification entre TaxHub et GeoNature, ajouter une variable ID_APP dans le fichier de configuration config.py et y mettre l'identifiant de l'application TaxHub tel qu'il est inscrit dans la table utilisateurs.t_applications. Exemple : ID_APP = 2
• Exécuter le script de migration SQL: https://github.com/PnX-SI/TaxHub/blob/master/data/update1.6.1to1.6.2.sql
• Suivez la procédure standard de mise à jour de TaxHub : https://taxhub.readthedocs.io/fr/latest/installation.html#mise-a-jour-de-l-application