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Notebook Jupyter pour repérer les publications d'un établissement pouvant être déposées HAL

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ml4rrieu/halathon

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HALathon : identifier automatiquement les publications pouvant être déposées dans HAL! Les données sur les publications sont récupérées (HAL, Unpaywall et Permissions ) et des actions, à réaliser manuellement, sont déduites.

Fonctionnement

  1. Récupérer les DOIs de son établissement. A effectuer depuis un fichier local ou depuis l'API de ScanR
  2. Enrichir les données en utilisant HAL, Unpaywall et Permissions
  3. Déduire à partir des données reccueillies des actions à réaliser

Actions déduites à réaliser manuellement

  • Récuperer le PDF éditeur et écrire a l'auteur pour accord 📗 📝

La publication n'est pas en accès ouvert mais la politique du publisher autorise le partage en archive de la version éditée (eg. la revue Physical Review B). Reste alors à contacter l'auteur pour avoir son accord.

  • Selon la licence ajouter le PDF éditeur 📗

La publication est en accès ouvert sur le site du publisher avec la mention d'une licence. Si celle-ci le permet (Creative Commons) ajouter le PDF dans HAL. Nota : le code cible les publications qui ne sont pas déjà dans une archive ouverte (logique de pérennisation).

  • Ecrire à l'auteur pour appliquer la LRN 📝

La publication n'est pas en accès ouvert, solliciter l'auteur afin qu'il applique la Loi pour une République Numérique.

  • Vérifier les identifiants de la notice 🔗

La publication est référencée dans HAL, elle est bien marquée open access dans Unpaywall mais HAL n'a pas fait le lien (métadonnée linkExtId). Il faut alors vérifier les identifiants (DOI, Arxiv) de la notice.

  • Créer ou retrouver la notice 🔎

Le DOI n'a pas été trouvé dans HAL. Faites une recherche par titre dans HAL afin de rectifier un éventuel oubli du DOI, créer la notice si nécessaire.


Reproduire pour son établissement

  • Télécharger le .zip du projet
  • Personnaliser casuhal_utils.py : renseigner l'embargo maximal à considérer (l'enjeu est de savoir si la politique du publisher est plus permissive que la LRN), renseigner un email pour les requêtes unpaywall
  • Ouvrir le notebook 2022_halathon.ipynb
  • Exécuter toutes les cellules
  • Ouvrir le tableau produit data\dois_a_traiter_formula.csv avec libreOffice
  • Déposez massivement 💥💥💥

Tester en ligne

Binder


Schéma de données

métadonnée explication exemple
halId
linkExtId disponibilité de la publication à l'extérieur de HAL openaccess, arxiv, pubmedcentral, itsex
upw_state statut d'accès ouvert dans Unpaywall open, closed, missing
published_date
oa_publisher_license licence présente sur le site de l'éditeur CC-BY
oa_publisher_link lien vers le PDF sur le site de l'éditeur
oa_repo_link lien vers le PDF disponible en archive
deposit_condition les conditions pour le dépôt en archive publishedVersion ; cc-by ; 2 months
todo action à réaliser manuellement selon licence ajouter PDF publisher

Outils et API utilisés


Statistiques

Halathon 2023-05 Université Paris Cité (FacultéSanté ). Scopus

nb de DOI a traiter                                          348
ecrire a l auteur pour appliquer la LRN                      144
selon la licence ajouter le PDF editeur                      129
creer ou retrouver la notice                                  63
recuperer le PDF editeur et ecrire a l auteur pour accord      9
verifier les identifiants de la notice                         2

Halathon 2022-05 Université Paris Cité (Faculté Sciences + IPGP). Scopus. 500 récentes publications.

nb de DOI a traiter                                          329

creer ou retrouver la notice                                 123
ecrire a l auteur pour appliquer la LRN                      119
selon la licence ajouter le PDF editeur                       66
recuperer le PDF editeur et ecrire a l auteur pour accord     15
verifier les identifiants de la notice                         2

CasuHalathon 2021-06 Université Paris Cité. Scopus. Publications de l'année

nb de DOI a traiter                                     1062
mailto auteur pour appliquer LRN                        564
creer/retrouver notice                                  273
selon licence ajouter PDF publisher                     204
verifier identifiants notice                              5
recuperer PDF publisher et mailto auteur pour accord      5

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  • req Scopus Santé

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  • req scopus faculté S&H

(AF-ID(60120303) OR AF-ID(60123643) OR AF-ID(60210180) OR AF-ID(60123161) OR AF-ID(60136261) OR AF-ID(60117541) OR AF-ID(60106086) OR AF-ID(60119214) OR AF-ID(60123637) OR AF-ID(60123696) OR AF-ID(60210118) OR AF-ID(60123629) OR AF-ID(60123670) OR AF-ID(60126107) OR AF-ID(60123675) OR AF-ID(60210117) OR AF-ID(60210182) OR AF-ID(60123642) OR AF-ID(60210166) OR AF-ID(60210148) OR AF-ID(60210170) OR AF-ID(60123662) OR AF-ID(60210181) OR AF-ID(60123653) OR AF-ID(60210168) OR AF-ID(60210171) OR AF-ID(60210144) OR AF-ID(60110966) OR AF-ID(60198731) OR AF-ID(60110705) OR AF-ID(60210157)

  • req Scopus faculté Sciences + IPGP

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