Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

Sign up for GitHub

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

Jump to bottom

VDB-5542: Removing reads that are subsequences of other reads #915

Open
wants to merge 1 commit into
base: master
Choose a base branch
from
Open

VDB-5542: Removing reads that are subsequences of other reads #915

Show file tree
Hide file tree
Changes from all commits
Commits
Show all changes
1 commit
Select commit
File filter

Filter by extension

Filter by extension
Conversations
Failed to load comments.
Loading
Jump to
Jump to file
Failed to load files.
Loading
Diff view
Diff view
5 changes: 5 additions & 0 deletions test/loaders/sharq/CMakeLists.txt
View file
Open in desktop
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -256,6 +256,11 @@ message(RE2_FOUND=${RE2_FOUND})
SharqTest(015.pending_spots 0 "${IN}015.R1.fq ${IN}015.R2.fq") # SRAO-632
SharqTestWithTelemetry(016.set.platform 0 "--platform=BGISEQ ${IN}001.R1.fastq") # SRAO-657

# has reads with duplicate subsequnces and should fail
SharqTest(017.dedup.fail 1 "${IN}017.R1.fq ${IN}017.R2.fq" "no-sa") # VDB--5542
# has reads with duplicate subsequnces but dedup shoudl clean them up
SharqTest(017.dedup.pass 0 "--dedup ${IN}017.R1.fq ${IN}017.R2.fq" "only-sa") # VDB--5542

endif()

endif()
1 change: 1 addition & 0 deletions test/loaders/sharq/expected/017.dedup.fail.stderr
View file
Open in desktop
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1 @@
[error] [code:170] SRAE-75: Collation check. Duplicate spot 'VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:50838:3007' at file input/017.R1.fq, line 25
80 changes: 80 additions & 0 deletions test/loaders/sharq/expected/017.dedup.pass.stdout
View file
Open in desktop
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,80 @@
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:22624:2893
reads 2:
num:1(B)
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACACAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
num:2(B)
GGACTACCTGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGTGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCC*CCCCCC5CCCCCCCC5CCC5CCCCCCC*CCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCC
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:34819:2931
reads 2:
num:1(B)
CCTACGGGATGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAGGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
num:2(B)
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGCGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
CCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCC5CCCCCCCC5CCC5C5CCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCC*CCCCCC
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:62540:3196
reads 2:
num:1(B)
CCTATGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCC
num:2(B)
GGACTACGTGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGCGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCC*CCCCCCCCCCC
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:50876:2893
reads 2:
num:1(B)
GGACTACGTGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGCGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
num:2(B)
CCTATGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CC*C
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:62711:2912
reads 2:
num:1(B)
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGCGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCATCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5*5CC5CCCCCCCC*CCCC5CCCCCC*C5CCCCC*5CCCC5*CCC5*C5CCCCCCCCCC**5C5C55CCCC5*C5*5CC5*C5C555C5**5555555CCC5*CCCC5CC*CC555555C55C5C5*C55555C55C5C5CC*5555C5CCCCCC55*CC
num:2(B)
CCTACGGGGGGCACCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACCTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCC5CCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCC5CCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCC*5CCCC5CCCC5CCCCCCCCCC5CCCC5CCCCC5CCCCCCC5CCCCCCCC*CCCCCCCCC
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:50838:3007
reads 2:
num:1(B)
GCGTCTACCTATGGGATGCAGCAGGTCACCCTGTGTGGTTGGGTCAATCGTCGTCGCGATCTTGGTAGCCTTATCTTTATTGATATGCGTGACCGCGAAGGTATCGTTCAGGTGTTCTTCGATCCGGATCGCGCTGATGCGTTGAAACTGGCTTCTGAGCTGCGCAATGAGTTCTGCTTTCAGGTGACGGGCACCGTGCGTGCGCGTGACGAGAAAAACGTCAACGCCGATATGGCGACCGGTGCTATCGAAGTGCTGGCGTCCGATCTGACGATCATCAACCGCGCGGAAGCGTTGCCG
+
C*CC5555*CCCCCCC555CCCCCC5C5C5555555555555C5C5CC5CC55CCC5CCCC555CC*5555CCCCCCCCCCCC5C5CCCCCCCCCC*CC55CCCC*55CCCC*5CCCC**CCCCCC*CC5C5CCCCCCCCCCCCC*CCC5C*C5CCCC55CCC5**CCCCCCC5CC5*5CC*C5CC5C5CC5C55CCCCCCCCCCC*CCC*CCCCCC5C55CCCCCCCC5CCC5C*CCCCCCCCC5CCC5CC5**CCC**C5C*CCC555C55**55555**55*555555C5CC5555*
num:2(B)
GCGTCTACCTACGGGAGGCACCAGGCTGGTGATTTTCGCACGGGTTTTCAGGCGCTGAGCCATTTCCGGACGACGCAGATCCAGGTAGCCGTATTACAGACGCGCTTCTTCGGTGTTGACGTGGTTGGAGTCCAGCGGCAACGCTTCCGCGCGGTTGATGATCGTCAGATCGGACGCCAGCACTTCGATAGCACCGGTCGCCATATCGGCGTTGCCGTTTTTCTCGTCACGCGCACGCACGGTGCCCGTCACCTGAATGCTGACCTCATTGCGCAGCTCAGAAGCCAGATTCAACTCATC
+
C5CCC5*CCCCC*CCCC*CCCCCCCC5*CCC*CC5CCCCC5CCCCCCCCCCCC5CCCC5C5C*CCCCCCCCC5CCCCCC*55CCC5C55*C5CCC*5C5CC5C5CCCCCCCC5CCC5*CCCCCC5C*5C5*55CC5CC5C5CCCCC*C5C5CCCCCCCCC555CC5CCC*CCCCCCC5C*CC*CC*55*C5CCC5C5CCCCC555CCC55CC5**C***55*55555555C5C5CCC5*5*5CC5555555CC55CC55C*5555555C*55555*5555C5C5555**555555*555*
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:23931:3026
reads 2:
num:1(B)
GGACTACATGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGCGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCC
num:2(B)
CCTACGGGGGGCACCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCC*CC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Spot: VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:66744:3120
reads 2:
num:1(B)
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTCCTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTACCCCCCTCTACAAGACTCTAGCCTGCCAGTTTCGAATGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCGGGGATTTCACATCCGACTTGACAGACCGCCTGCGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAG
+
????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
num:2(B)
CCTATGGGGTGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
34 changes: 34 additions & 0 deletions test/loaders/sharq/input/017.R1.fq
View file
Open in desktop
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,34 @@
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:22624:2893 1:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACACAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:34819:2931 1:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTACGGGATGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAGGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:50838:3007 1:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTATGGGATGCAGCAGGTCACCCTGTGTGGTTGGGTCAATCGTCGTCGCGATCTTGGTAGCCTTATCTTTATTGATATGCGTGACCGCGAAGGTATCGTTCAGGTGTTCTTCGATCCGGATCGCGCTGATGCGTTGAAACTGGCTTCTGAGCTGCGCAATGAGTTCTGCTTTCAGGTGACGGGCACCGTGCGTGCGCGTGACGAGAAAAACGTCAACGCCGATATGGCGACCGGTGCTATCGAAGTGCTGGCGTCCGATCTGACGATCATCAACCGCGCGGAAGCGTTGCCG
+
5*CCCCCCC555CCCCCC5C5C5555555555555C5C5CC5CC55CCC5CCCC555CC*5555CCCCCCCCCCCC5C5CCCCCCCCCC*CC55CCCC*55CCCC*5CCCC**CCCCCC*CC5C5CCCCCCCCCCCCC*CCC5C*C5CCCC55CCC5**CCCCCCC5CC5*5CC*C5CC5C5CC5C55CCCCCCCCCCC*CCC*CCCCCC5C55CCCCCCCC5CCC5C*CCCCCCCCC5CCC5CC5**CCC**C5C*CCC555C55**55555**55*555555C5CC5555*
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:62540:3196 1:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTATGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCC
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:50876:2893 2:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTATGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CC*C
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:62711:2912 2:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTACGGGGGGCACCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACCTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCC5CCCCCC*CCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCC5CCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCC*5CCCC5CCCC5CCCCCCCCCC5CCCC5CCCCC5CCCCCCC5CCCCCCCC*CCCCCCCCC
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:50838:3007 2:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTACGGGAGGCACCAGGCTGGTGATTTTCGCACGGGTTTTCAGGCGCTGAGCCATTTCCGGACGACGCAGATCCAGGTAGCCGTATTACAGACGCGCTTCTTCGGTGTTGACGTGGTTGGAGTCCAGCGGCAACGCTTCCGCGCGGTTGATGATCGTCAGATCGGACGCCAGCACTTCGATAGCACCGGTCGCCATATCGGCGTTGCCGTTTTTCTCGTCACGCGCACGCACGGTGCCCGTCACCTGAATGCTGACCTCATTGCGCAGCTCAGAAGCCAGATTCAACTCATC
+
CCCCC*CCCC*CCCCCCCC5*CCC*CC5CCCCC5CCCCCCCCCCCC5CCCC5C5C*CCCCCCCCC5CCCCCC*55CCC5C55*C5CCC*5C5CC5C5CCCCCCCC5CCC5*CCCCCC5C*5C5*55CC5CC5C5CCCCC*C5C5CCCCCCCCC555CC5CCC*CCCCCCC5C*CC*CC*55*C5CCC5C5CCCCC555CCC55CC5**C***55*55555555C5C5CCC5*5*5CC5555555CC55CC55C*5555555C*55555*5555C5C5555**555555*555*
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:23931:3026 2:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTACGGGGGGCACCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
+
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCC*CC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC*CCCCCCCCCC5CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
@VH01171:37:AAF2527M5:1:1101:66744:3120 2:N:0:CCGTCCCG+AGATCTCG
CCTATGGGGTGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGCGATAAGGTTAATAACCTTGTCGATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG
Loading