meeting_20170926

2017-09-26 打合せ

日時: 2017-09-26（火）13:00-
場所: W207
参加: 岡別府、大石、藤澤、児玉、

アジェンダ

• 運用チームとの調整事項
• 進捗確認
• スパコンチームとの調整事項

運用チームとの調整事項

• サーバ構成と死活監視方法 資料
• ValidatorAPIのステージング版からアクセスする、ステージング用PostgreSQLの準備依頼
• ValidationAPIの仕様説明 資料
  • D-Wayから送られるBioSampleXMLの形式について 参照
• D-way組み込みにあたってのValidationの仕様調整
  • 新規OrganismとしてTaxID:1(taxid不明)が入力された場合に、rule4(Taxonomy name and id not match)でerrorが発生し、submitできなくなる
  • 一部XMLデータで"sample_name"属性の記載がないデータがある(SSUB000263, SSUB000358).要素には記載があるが、このようなデータになる操作経路があるか(両方に同じ値)

進捗確認

• BioProject Validationの実装(岡別府)　(27/27ルール)
• DRA Validationの実装(岡別府)　(29/32ルール)
• biosample package の rdf に tsv での提供順情報を持たせる (藤澤)
• テスト
  • 現状登録中のBioSampleSubmission(6533件)のデータに対して一括でValidation(v0.9.0)を実施 結果
• 安定稼働対策
  • unicornの自動起動設定/unicorn-worker-killerの導入?
  • validatorの死活監視と通知メール設定
  • セキュリティ対応(インジェクション等)
• 更新手順書等ドキュメント作成

スパコンチームとの調整事項

• t013/t014のValidatorAPIを管理者(キュレータ)から閲覧できるようにする => スパコンTに依頼